2017年12月9日 星期六

Bioinformatics

2017下半年的閒暇時間幾乎都在搞bioinformatics。

說來有兩個原因。第一是新工作的原因,開始比較大量地接觸生物科技的東西,為了搞清楚同事們到底再說些什麼,就自己東看西看,到處google一些相關的東西。不過,自己東查西找非常沒有系統,知識也非常零散。 另一原因,是自己那時在看"改變世界的演算法"一書。同時在想的兩件事,有一個共同的交集,就是bioinformatics。於是在線上課的網站上找到了ucsd的一系列課程。

就不知不覺地把絕大部分閒暇的時間都投在這系列的課上了。這系列的課算同時比較有系統地滿足我在想的兩件事,工程在生物的應用和演算法。所以bioinformatics就成了一個切入點,然後,再開始延伸其它領域。

撇開那些演算法和生物上的東西,它很像我原來接觸的生物工程領域,跨領域最大問題就是合作。這問題比工程領域裡軟體/硬體的分類邏輯還要分歧,生物和工程領域的合作。最見的是生物的人覺得想讀懂生物上的意義才是重點,工程技術只是小技巧;所以生物的人根本不care工程上的突破,根本不appreciate工程上的新idea。就像醫生們覺得在醫學領域他們最重要,但是,許多新的診斷儀器,藥,NGS…等的技術,也不完全是醫生搞出來的吧,絕大部分還是一個科學和工程團隊的結果。 沒有計算機,現代很多生物上的東西也根本沒辦法解讀,而現代的電腦正是工程師們的心血。

而我,正在這兩個領域裡打滾,試著聽懂而融入生物領域的邏輯思維,而又要在自己原來的工程領域更深耕,的確有很多事要忙。也許在這一系列的課之後,下一步要來思考一下機器學習在我現在的計畫上有沒有幫助了。





2 則留言:

  1. 原來你也有這樣的感覺,Hsin一直說我們把他們當作工具人,心裡一直過不去呢。

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  2. 是啊,生物和工程領域一直有這樣的問題。學生物的總覺得工程上的東西都是細微的雜事,不是什麼重要的東西。沒有這些生物人認為枝微末節的技術,很多東西也無法走到今天這樣。

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